陽春砂花絲、花柱轉錄組測序及生物信息學分析

【摘要】：為進一步探究陽春砂假合蕊柱形成機制，基于RNA-Seq技術對不同生長時期陽春砂花絲、花柱進行轉錄組測序及生物信息學分析，獲得陽春砂轉錄組數據并篩選出激素合成及信號轉導通路基因，為后續研究陽春砂基因功能、代謝途徑、花器官發育及運動調控機理等方面提供參考。結果表明，測序數據拼接組裝后獲得94 584條Unigene,總長度為92 501 015 bp。將獲得的Unigene分別在NR、GO、KOG和KEGG等七大數據庫中進行比對，共有62 174條Unigene得到注釋，占全部Unigene的65.73%;NR數據庫中注釋到58 669條Unigene,被注釋的同源序列主要來自于小果野芭蕉；有45 892條Unigene注釋到KOG數據庫中，涉及25個功能分類；GO數據庫注釋Unigene 12 050條，按照功能分為3個大類及55個亞類；KEGG數據庫中，有44 000條Unigene注釋到137個代謝通路中；SSR特征分析中共檢測到18 895個位點，三堿基重復的數目最多，達到6 313個，占比為33.41%。2012條Unigene被注釋到9種不同激素的合成與信號轉導途徑中，赤霉素的Unigene被注釋到最多，共有505條。本研究通過構建陽春砂花絲、花柱的轉錄組數據庫并進行生物信息學分析，為陽春砂花器官發育相關基因的發掘及利用、基因組的測序與組裝、表達譜的比對提供科學依據，也為后續在分子生物學層面對陽春砂假合蕊柱的形成機制開展深入研究提供理論基礎。